La trama principal de "NieR: Automata" se divide en tres procesos. Si bien hay mucha superposición entre los dos primeros pases, el tercero deja en claro que todavía queda mucha historia por explorar incluso después de la primera partida.
Aunque debes completar tres procesos principales, hay múltiples finales en el juego, algunos son más completos que otros y algunos requieren que desempeñes roles específicos y realices acciones específicas. A continuación se enumeran los tres personajes jugables y cómo cambiar entre ellos.
La historia de "NieR: Automata" gira en torno a 2B, 9S y A2. 2B y 9S son compañeros y, dependiendo de cuánto tiempo dediques a cada proceso, es probable que los dos obtengan la mayor cantidad de tiempo de juego. Cada personaje tiene su propio estilo de lucha único, e incluso si siempre equipas el mismo chip enchufable, jugar como cada personaje en las tres transmisiones brinda una nueva experiencia. 2B, 9S y A2 son personajes controlables a lo largo del juego, pero cambiar de personaje de control puede no ser fácil.
En el primer proceso del juego, no puedes cambiar de personaje en ningún momento. El personaje que controlas en cada proceso es:
Después de seleccionar uno de los finales principales del juego, desbloquearás el modo de selección de capítulo, donde ahora puedes elegir el personaje que deseas controlar. Usando el modo de selección de capítulo, puedes elegir cualquiera de los 17 capítulos del juego para comenzar de nuevo. En muchos capítulos, verás que los números en el lado derecho de la pantalla cambian según las misiones secundarias completadas o incompletas. Si un personaje muestra algún número en el capítulo, puedes optar por reproducir el capítulo como ese personaje.
Algunos capítulos posteriores, en su mayoría el proceso 3, solo te permiten reproducir capítulos específicos con personajes específicos, esto no cambiará. La selección de capítulo te permite cambiar tu personaje en cualquier momento, pero también necesitarás cambiar el progreso de tu juego a donde ese personaje pueda controlar en la historia principal. Siempre que guardes tu juego antes de ingresar a otro capítulo, cualquier acción completada en el modo de selección de capítulo se conservará, lo que te permitirá aumentar el nivel compartido de los tres personajes a medida que avanzas hacia el nivel máximo.